临床上，五氟利多除可用于治疗精神分裂症，还可用于治疗其它精神疾病，如双相障碍、躁狂症、强迫症等。
既然五氟利多的疗效如此好，是否可以作为所有精神病患者各期治疗的一线药物呢？不可以，因为它也不是对所有患者都有效，并且，五氟利多是一个旧的抗精神病药物，有其相关的副作用，如锥体外系副作用，尤其是迟发性运动障碍（TD），TD通常要用药较长时间后才出现，但一旦出现，有时就是不可逆的，是一种严重的致残性副作用。
五氟利多用于双相躁狂的治疗，其疗效有时比情感稳定剂还要好，但有一个隐患，那就是容易诱发转相，即使患者从躁狂相转为抑郁相，此时容易出现自杀行为。我见有些网上咨询的案例，明显提示是双相障碍，却被当作精神分裂症，用五氟利多治疗，一定要记住，此时自杀风险增加。
在用五氟利多治疗期间，如果出现紧急情况需要停药时（如感染高热），会比较麻烦，因为即使停了药，其血中浓度下降很慢。
